32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3169 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3169  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  165  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3632  hypothetical protein  67.07 
 
 
82 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596727  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3915  hypothetical protein  70 
 
 
80 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0518092  normal  0.105053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3925  hypothetical protein  67.09 
 
 
82 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1580  hypothetical protein  53.25 
 
 
80 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.948957  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2595  hypothetical protein  52.7 
 
 
79 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0610433  normal  0.1614 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2922  hypothetical protein  54.93 
 
 
81 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  52.11 
 
 
79 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2605  hypothetical protein  53.52 
 
 
80 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0504919  hitchhiker  0.00914648 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2867  hypothetical protein  53.52 
 
 
80 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245233  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1774  hypothetical protein  49.3 
 
 
79 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5333  hypothetical protein  54.17 
 
 
77 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.583996 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4921  hypothetical protein  66.67 
 
 
78 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  51.11 
 
 
105 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  59.38 
 
 
101 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  56.41 
 
 
93 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  62.5 
 
 
101 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0416  hypothetical protein  57.58 
 
 
105 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  40.85 
 
 
101 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  38.1 
 
 
109 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  38.1 
 
 
109 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  50 
 
 
89 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  45.95 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  53.12 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  43.59 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  43.59 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3227  hypothetical protein  55.17 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364796  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  47.5 
 
 
113 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2475  hypothetical protein  43.14 
 
 
94 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.683905 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1214  hypothetical protein  48.48 
 
 
92 aa  41.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.314538 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  42.5 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  50 
 
 
105 aa  40  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>