52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2595 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2595  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0610433  normal  0.1614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1774  hypothetical protein  78.48 
 
 		 79 aa  133  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2922  hypothetical protein  83.33 
 
 		 81 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2605  hypothetical protein  81.01 
 
 		 80 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0504919  hitchhiker  0.00914648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  76.92 
 
 		 79 aa  123  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2867  hypothetical protein  79.75 
 
 		 80 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1580  hypothetical protein  65.33 
 
 		 80 aa  97.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.948957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3632  hypothetical protein  54.55 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3915  hypothetical protein  56 
 
 		 80 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0518092  normal  0.105053 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5333  hypothetical protein  52.63 
 
 		 77 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.583996 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3925  hypothetical protein  54.55 
 
 		 82 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4921  hypothetical protein  52.63 
 
 		 78 aa  67  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  64.86 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  63.89 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  62.86 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0416  hypothetical protein  64.86 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3169  hypothetical protein  67.65 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1214  hypothetical protein  66.67 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.314538 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  67.65 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  60.61 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  39.68 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  57.58 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  52.78 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  52.78 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  51.52 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  51.16 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  58.82 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  55.56 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3227  hypothetical protein  56.25 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364796  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  59.38 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  44.74 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  45 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  47.5 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2181  hypothetical protein  54.29 
 
 		 96 aa  42  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0287  hypothetical protein  34.48 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  51.52 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2294  hypothetical protein  54.29 
 
 		 96 aa  42  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.300358  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  44.74 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  57.58 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2071  hypothetical protein  54.29 
 
 		 96 aa  42  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000174613  hitchhiker  0.000046797 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  54.55 
 
 		 101 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0642  hypothetical protein  48.48 
 
 		 95 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.343821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  43.75 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  48.48 
 
 		 84 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  39.13 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  48.48 
 
 		 84 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  48.48 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  47.06 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1185  hypothetical protein  46.88 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.294594 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  47.06 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  48.57 
 
 		 104 aa  40  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>