67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1999 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  205  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  43.96 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  44.94 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  39.18 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  49.18 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  43.82 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  43.82 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  39.77 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  43.82 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  37.65 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  38 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  41.57 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  42.31 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  42.31 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0287  hypothetical protein  36.79 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  43.59 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  49.15 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  39.08 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  43.1 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  47.54 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4374  hypothetical protein  37.04 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00628463  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0524  hypothetical protein  34.12 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0112634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  38.46 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4943  hypothetical protein  39.44 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2220  hypothetical protein  40 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2536  hypothetical protein  36.99 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  41.51 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1693  phage protein  34.18 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0612931 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1019  hypothetical protein  35.71 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1281  hypothetical protein  45 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2273  hypothetical protein  47.5 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  46.15 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  46.15 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  34.34 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1702  phage protein  36.14 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  51.43 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5333  hypothetical protein  47.62 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.583996 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3907  putative cytoplasmic protein  40.35 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4942  hypothetical protein  45.45 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.809996 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  51.43 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4935  hypothetical protein  45.45 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3352  hypothetical protein  34 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  51.43 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2739  hypothetical protein  34.21 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  52.94 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  47.37 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2605  hypothetical protein  51.43 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0504919  hitchhiker  0.00914648 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1995  hypothetical protein  27.06 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0383118 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1585  hypothetical protein  39.34 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.849513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1561  hypothetical protein  39.34 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1968  hypothetical protein  27.06 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  47.37 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  43.24 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  37.04 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2867  hypothetical protein  51.43 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2520  hypothetical protein  34.57 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  45.65 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4921  hypothetical protein  46.15 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  48.57 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2868  hypothetical protein  42.5 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0642  hypothetical protein  36.23 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.343821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2595  hypothetical protein  48.57 
 
 		 79 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0610433  normal  0.1614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>