41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2536 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2536  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  227  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  55.13 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  47.22 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  47.22 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  47.22 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  48.53 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1995  hypothetical protein  41.03 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0383118 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1968  hypothetical protein  41.03 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4374  hypothetical protein  45.83 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00628463  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  45.07 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  44.44 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  48.39 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  46.15 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0524  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0112634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  47.44 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  47.69 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4943  hypothetical protein  43.75 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4942  hypothetical protein  40.85 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.809996 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  41.18 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4935  hypothetical protein  43.08 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  44.44 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  32.47 
 
 		 98 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2273  hypothetical protein  46.03 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3907  putative cytoplasmic protein  42.19 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  36.99 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  32.47 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  44.9 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  59.38 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  44.9 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  47.37 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2436  hypothetical protein  38.36 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0287  hypothetical protein  54.55 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3519  hypothetical protein  36.99 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0169675  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  43.9 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  52.63 
 
 		 79 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4135  hypothetical protein  57.14 
 
 		 54 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1281  hypothetical protein  38.98 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2220  hypothetical protein  35.94 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  51.61 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>