51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4942 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4942  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  206  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.809996 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4935  hypothetical protein  98.98 
 
 		 98 aa  199  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4943  hypothetical protein  83 
 
 		 100 aa  174  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  56.32 
 
 		 105 aa  110  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3907  putative cytoplasmic protein  50 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2220  hypothetical protein  49.43 
 
 		 106 aa  87  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2273  hypothetical protein  52.11 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  42.22 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  42.68 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1281  hypothetical protein  45 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3352  hypothetical protein  36.46 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  45.45 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  41.03 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  38.2 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  41.03 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  41.03 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  40.74 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  44.59 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  39.47 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  37.8 
 
 		 84 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  37.8 
 
 		 84 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  37.63 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2536  hypothetical protein  40.85 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  53.66 
 
 		 92 aa  52  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  33.77 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  51.22 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  44.83 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  45.45 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1995  hypothetical protein  32.93 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0383118 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1968  hypothetical protein  32.93 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  41.03 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  41.86 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1806  hypothetical protein  62.96 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.832852  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0287  hypothetical protein  32.61 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  28.71 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  44.68 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  46.34 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2489  hypothetical protein  33.67 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.394222  normal  0.792208 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  51.52 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  51.52 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  48.72 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  48.57 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  48.72 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  46.34 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  41.03 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4374  hypothetical protein  34.78 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00628463  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1314  CopG domain protein DNA-binding domain protein  43.9 
 
 		 80 aa  40  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153702 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  43.75 
 
 		 104 aa  40  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  36.25 
 
 		 101 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>