54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2273 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2273  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  179  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2220  hypothetical protein  57.14 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4935  hypothetical protein  51.69 
 
 		 98 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4942  hypothetical protein  49.44 
 
 		 100 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.809996 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  51.81 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4943  hypothetical protein  51.19 
 
 		 100 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3907  putative cytoplasmic protein  43.18 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  47.78 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  46.51 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1281  hypothetical protein  53.33 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  44.71 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  44.71 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  41.76 
 
 		 84 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3352  hypothetical protein  43.48 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  42.17 
 
 		 84 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  45 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  52.24 
 
 		 85 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  47.76 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  38.1 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  36.9 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  42.86 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  39.29 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  39.76 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  57.5 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  54.05 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  40.85 
 
 		 103 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2536  hypothetical protein  42.65 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  47.83 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  37.93 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  39.44 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  37.93 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4374  hypothetical protein  38.67 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00628463  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  46.15 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  40.3 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  40.48 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  36.36 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  47.5 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4921  hypothetical protein  45 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  35.71 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  58.82 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0287  hypothetical protein  40.48 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1968  hypothetical protein  26.67 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1995  hypothetical protein  26.67 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0383118 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1314  CopG domain protein DNA-binding domain protein  51.22 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153702 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0265  hypothetical protein  48.72 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  57.14 
 
 		 105 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  51.43 
 
 		 104 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  44.44 
 
 		 79 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  50 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  46.15 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1185  hypothetical protein  42.11 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.294594 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  40.3 
 
 		 90 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>