64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1634 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  191  4e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  98.91 
 
 		 92 aa  189  9e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  40.51 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  64.71 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  38.75 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  57.14 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  65.71 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  35.42 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  46.03 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  46.88 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4942  hypothetical protein  53.66 
 
 		 100 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.809996 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4943  hypothetical protein  46.55 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4935  hypothetical protein  53.66 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  40.32 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  32.91 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  48.78 
 
 		 85 aa  50.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0287  hypothetical protein  61.76 
 
 		 107 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  64.71 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  34.04 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3907  putative cytoplasmic protein  35.44 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1806  hypothetical protein  40.79 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.832852  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  58.82 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  34.04 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1281  hypothetical protein  38.33 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  47.37 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  58.82 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  47.37 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  47.37 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  58.06 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  58.06 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2273  hypothetical protein  37.93 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  34.52 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  34.48 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2220  hypothetical protein  32.89 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  31.03 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4374  hypothetical protein  54.84 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00628463  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  32 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3519  hypothetical protein  40.48 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0169675  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  45.71 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2436  hypothetical protein  42.86 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3352  hypothetical protein  32.97 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2262  hypothetical protein  42.86 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.490348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  29.27 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  45.71 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1995  hypothetical protein  47.06 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0383118 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1968  hypothetical protein  47.06 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  48.48 
 
 		 82 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  48.39 
 
 		 104 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  48.28 
 
 		 96 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  48.48 
 
 		 82 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  52.94 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  45.71 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  37.84 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2294  hypothetical protein  34.25 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.300358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2071  hypothetical protein  34.25 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000174613  hitchhiker  0.000046797 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2181  hypothetical protein  34.25 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  44.12 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  47.06 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  29.79 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2536  hypothetical protein  51.61 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>