70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2250 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  228  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  45.78 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  43.96 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  44.94 
 
 		 98 aa  70.1  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  44.44 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  41.18 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  43.42 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  36.26 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  46.25 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  42.17 
 
 		 84 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  41.98 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4374  hypothetical protein  37.5 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00628463  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  46.15 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0287  hypothetical protein  40.51 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  41.56 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  50 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  41.25 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  43.08 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  68.57 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2273  hypothetical protein  47.62 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  65.71 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1281  hypothetical protein  32.47 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4943  hypothetical protein  35.06 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  42.03 
 
 		 89 aa  52  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4942  hypothetical protein  33.77 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.809996 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4935  hypothetical protein  33.77 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3352  hypothetical protein  38.1 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0524  hypothetical protein  33.73 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0112634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  34.12 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3907  putative cytoplasmic protein  40.74 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  31.87 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  38.57 
 
 		 93 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  45 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  45 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2739  hypothetical protein  32.91 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  33.68 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2220  hypothetical protein  40 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2520  hypothetical protein  29.11 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2536  hypothetical protein  32.47 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1968  hypothetical protein  30.49 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1995  hypothetical protein  30.49 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0383118 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  35.8 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1008  hypothetical protein  41.07 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1314  CopG domain protein DNA-binding domain protein  48.84 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153702 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1585  hypothetical protein  34.78 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.849513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1561  hypothetical protein  34.78 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  51.52 
 
 		 82 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  42.11 
 
 		 109 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  51.52 
 
 		 82 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  51.52 
 
 		 104 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  32.88 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1019  hypothetical protein  47.37 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  47.06 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  48.48 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  44.74 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  34.78 
 
 		 104 aa  40.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  44.74 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0265  hypothetical protein  43.59 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2475  hypothetical protein  27.4 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.683905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1185  hypothetical protein  36.49 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.294594 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  51.52 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0612  hypothetical protein  42.22 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  53.33 
 
 		 79 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>