53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2220 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2220  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2273  hypothetical protein  63.01 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  52.38 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4935  hypothetical protein  50.57 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4942  hypothetical protein  49.43 
 
 		 100 aa  87  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.809996 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3907  putative cytoplasmic protein  47.5 
 
 		 92 aa  84.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1281  hypothetical protein  51.9 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4943  hypothetical protein  53.42 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  44.94 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3352  hypothetical protein  48.75 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  44.05 
 
 		 84 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  47.37 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  46.25 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  46.25 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  45.21 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  42.31 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  45.45 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  44.16 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  42.86 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  42.67 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  38.2 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  44.44 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  58.82 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  31.76 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  50 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  36.84 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  42.11 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1806  hypothetical protein  38.1 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.832852  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  34.38 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  32.89 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  42.11 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  46.15 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  32.79 
 
 		 93 aa  42.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  31.58 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  41.54 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4374  hypothetical protein  36.36 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00628463  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  36 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  52.78 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  36 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  38.57 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2536  hypothetical protein  35.94 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  39.29 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  38.57 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0287  hypothetical protein  41.46 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  51.52 
 
 		 112 aa  40  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  51.52 
 
 		 112 aa  40  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>