53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0287 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0287  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  221  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  74.44 
 
 
93 aa  143  9e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  55.22 
 
 
79 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  29.91 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  40.51 
 
 
114 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  37.8 
 
 
98 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  36.79 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  62.79 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  37.5 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  34.31 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  40 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  34.31 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  38.75 
 
 
98 aa  55.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  44.23 
 
 
106 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  48.98 
 
 
84 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  54.55 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  34.52 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  34.88 
 
 
85 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  37.04 
 
 
85 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  37.18 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  61.76 
 
 
92 aa  50.8  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  33.33 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  33.33 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  30.39 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  44.9 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  58.82 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  45.45 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  33.72 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  42.5 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  46.34 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2536  hypothetical protein  54.55 
 
 
108 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2273  hypothetical protein  40.48 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2194  hypothetical protein  28.57 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  40.91 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  45.45 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  40.91 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2262  hypothetical protein  43.75 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.490348 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2595  hypothetical protein  34.48 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0610433  normal  0.1614 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2294  hypothetical protein  43.24 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.300358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2071  hypothetical protein  43.24 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000174613  hitchhiker  0.000046797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3907  putative cytoplasmic protein  48.57 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2181  hypothetical protein  43.24 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  36.59 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4935  hypothetical protein  32.61 
 
 
98 aa  40.8  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4942  hypothetical protein  32.61 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.809996 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  42.86 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  42.86 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  41.18 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2867  hypothetical protein  50 
 
 
80 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245233  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2220  hypothetical protein  41.46 
 
 
106 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  45.71 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2605  hypothetical protein  50 
 
 
80 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0504919  hitchhiker  0.00914648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>