49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3423 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  192  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  56.79 
 
 		 98 aa  97.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  53.66 
 
 		 85 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  51.85 
 
 		 85 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  53.09 
 
 		 84 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  51.85 
 
 		 84 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  51.85 
 
 		 84 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  54.55 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  48.1 
 
 		 98 aa  80.1  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2273  hypothetical protein  53.52 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2220  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4943  hypothetical protein  46.34 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  42.17 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4935  hypothetical protein  42.68 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4942  hypothetical protein  42.68 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.809996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2536  hypothetical protein  46.15 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3907  putative cytoplasmic protein  43.75 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  45.21 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1281  hypothetical protein  46.84 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4374  hypothetical protein  40.74 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00628463  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1968  hypothetical protein  36.47 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1995  hypothetical protein  36.47 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0383118 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  34.91 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  41.25 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3352  hypothetical protein  45.07 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  46.38 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  37.78 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  43.04 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  34.26 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  34.02 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  33.94 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0524  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0112634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  42.67 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  40.79 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  42.67 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  40.79 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  34.12 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1886  hypothetical protein  43.75 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  35.71 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  30.16 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0287  hypothetical protein  33.72 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  48.28 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  48.28 
 
 		 92 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  35.21 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1314  CopG domain protein DNA-binding domain protein  42.86 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3519  hypothetical protein  38.57 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0169675  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1007  hypothetical protein  29.21 
 
 		 109 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.472724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>