31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1314 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1314  CopG domain protein DNA-binding domain protein  100 
 
 		 80 aa  164  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153702 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2415  hypothetical protein  97.47 
 
 		 80 aa  158  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.612018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2046  CopG domain protein DNA-binding domain protein  97.47 
 
 		 80 aa  158  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.30352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1008  hypothetical protein  57.5 
 
 		 83 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0787  CopG/DNA-binding domain-containing protein  57.69 
 
 		 82 aa  90.9  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0154  hypothetical protein  50.62 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426804  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0264  hypothetical protein  46.25 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1870  hypothetical protein  47.69 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2757  hypothetical protein  49.09 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  54.55 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  54.55 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2196  hypothetical protein  42.11 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0130  hypothetical protein  42.11 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1617  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.11384  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  54.55 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2271  hypothetical protein  42.37 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.941598  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  49.12 
 
 		 85 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0659  hypothetical protein  39.66 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  48.84 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  43.48 
 
 		 105 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4935  hypothetical protein  41.51 
 
 		 98 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  42.55 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4943  hypothetical protein  41.51 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  42.86 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  50 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4094  hypothetical protein  33.87 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.987137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2273  hypothetical protein  47.73 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4942  hypothetical protein  43.9 
 
 		 100 aa  40  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.809996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  41.67 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>