64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1491 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  216  6e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  50 
 
 
98 aa  79  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  49.18 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  41.49 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  42.53 
 
 
106 aa  72  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  51.32 
 
 
85 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  37.11 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  37.78 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  38.57 
 
 
79 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  37.11 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  46.25 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  41.43 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  38.75 
 
 
98 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  41.25 
 
 
96 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  38.37 
 
 
91 aa  61.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  39.51 
 
 
85 aa  60.5  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  50.85 
 
 
84 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  48.33 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  48.33 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0287  hypothetical protein  37.5 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  38.46 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  35.9 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2536  hypothetical protein  50 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  57.14 
 
 
92 aa  54.3  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  33.68 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4935  hypothetical protein  50 
 
 
98 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  54.29 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2273  hypothetical protein  57.5 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4942  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.809996 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4943  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3907  putative cytoplasmic protein  39.02 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  40.22 
 
 
101 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4374  hypothetical protein  34.12 
 
 
88 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00628463  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  42.19 
 
 
101 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0642  hypothetical protein  39.39 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.343821  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2220  hypothetical protein  58.82 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1008  hypothetical protein  48.84 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1968  hypothetical protein  34.48 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1995  hypothetical protein  34.48 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0383118 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1281  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  52.94 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  42.86 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  52.94 
 
 
104 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  41.43 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  51.43 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  42.03 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  42.03 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  41.43 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1314  CopG domain protein DNA-binding domain protein  43.48 
 
 
80 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  46.51 
 
 
109 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  55.88 
 
 
112 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  55.88 
 
 
112 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3352  hypothetical protein  41.38 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4921  hypothetical protein  51.52 
 
 
78 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2739  hypothetical protein  36.11 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  47.06 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  35 
 
 
90 aa  40.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1774  hypothetical protein  51.43 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  38.78 
 
 
104 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2262  hypothetical protein  42.62 
 
 
69 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.490348 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2436  hypothetical protein  41.18 
 
 
79 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1702  phage protein  31.11 
 
 
101 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>