102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1489 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  230  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2520  hypothetical protein  46.15 
 
 
99 aa  77.4  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  43.01 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  50.67 
 
 
90 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  50.67 
 
 
90 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  46.67 
 
 
109 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  52.86 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  36.11 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1019  hypothetical protein  38 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  33.33 
 
 
105 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  36.08 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  44.71 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  36.26 
 
 
114 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  40.66 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  40.22 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  37.63 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0287  hypothetical protein  29.91 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  52.11 
 
 
103 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  42.35 
 
 
101 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  39.13 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  43.55 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  43.55 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2739  hypothetical protein  42.31 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1693  phage protein  39.74 
 
 
101 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0612931 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1702  phage protein  39.74 
 
 
101 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18489 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1041  hypothetical protein  40.7 
 
 
94 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144032  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  42.68 
 
 
90 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1943  hypothetical protein  39.53 
 
 
94 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0543  hypothetical protein  39.53 
 
 
94 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  49.25 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  49.25 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  39.08 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  45.59 
 
 
93 aa  58.2  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2868  hypothetical protein  52.27 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4374  hypothetical protein  35.35 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00628463  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0642  hypothetical protein  45.21 
 
 
95 aa  57.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.343821  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1886  hypothetical protein  34.83 
 
 
88 aa  57  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  38.46 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3099  hypothetical protein  50 
 
 
93 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  37.04 
 
 
109 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  36.67 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  37.04 
 
 
109 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  36.67 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  39.56 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  41.43 
 
 
104 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  35.87 
 
 
98 aa  53.5  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2652  hypothetical protein  42.19 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.294685  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2475  hypothetical protein  54.1 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.683905 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2536  hypothetical protein  44.44 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  41.43 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0416  hypothetical protein  39.76 
 
 
105 aa  52  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1185  hypothetical protein  40 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.294594 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  39.13 
 
 
101 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  28.89 
 
 
84 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  33.71 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  36.71 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  35.79 
 
 
105 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2181  hypothetical protein  44.68 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2071  hypothetical protein  44.68 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000174613  hitchhiker  0.000046797 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2294  hypothetical protein  44.68 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.300358  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  35.8 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  28.89 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2436  hypothetical protein  40.54 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3498  hypothetical protein  44.44 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2262  hypothetical protein  35.37 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.490348 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  39.73 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  28.89 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1506  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735616  normal  0.160374 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0524  hypothetical protein  34.07 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0112634  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3519  hypothetical protein  40.54 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0169675  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  46.15 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  32.94 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1007  hypothetical protein  37.68 
 
 
109 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2867  hypothetical protein  60.61 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245233  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2605  hypothetical protein  60.61 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0504919  hitchhiker  0.00914648 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1774  hypothetical protein  63.64 
 
 
79 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3086  hypothetical protein  47.06 
 
 
66 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3034  hypothetical protein  47.06 
 
 
66 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.935621  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3227  hypothetical protein  35.9 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364796  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5229  hypothetical protein  47.83 
 
 
76 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.532007 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  31.03 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4943  hypothetical protein  38.27 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  30.43 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1561  hypothetical protein  46.51 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1585  hypothetical protein  46.51 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.849513 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1281  hypothetical protein  35.63 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0265  hypothetical protein  41.51 
 
 
112 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  29.27 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2595  hypothetical protein  57.58 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0610433  normal  0.1614 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1214  hypothetical protein  38.46 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.314538 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5333  hypothetical protein  48.84 
 
 
77 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.583996 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  28.05 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3169  hypothetical protein  56.25 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3915  hypothetical protein  59.38 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0518092  normal  0.105053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2922  hypothetical protein  57.58 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0612  hypothetical protein  43.59 
 
 
81 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  37.5 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0628  hypothetical protein  43.59 
 
 
65 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>