71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0543 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1943  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  193  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0543  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  193  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1041  hypothetical protein  98.94 
 
 		 94 aa  192  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144032  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  52.04 
 
 		 98 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1702  phage protein  49.46 
 
 		 101 aa  93.6  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18489 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1693  phage protein  48.39 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0612931 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  44.44 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2520  hypothetical protein  41.3 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  44.44 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2739  hypothetical protein  40.23 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  45.24 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  40.38 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  40.38 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  40.86 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1886  hypothetical protein  58.33 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  43.43 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  60 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  57.89 
 
 		 90 aa  67  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  56.14 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  56 
 
 		 100 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  52.08 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  56 
 
 		 100 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1185  hypothetical protein  55.32 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.294594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0416  hypothetical protein  46.51 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  61.9 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  42.7 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  39.53 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2294  hypothetical protein  53.19 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.300358  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2868  hypothetical protein  53.85 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2181  hypothetical protein  53.19 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2071  hypothetical protein  53.19 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000174613  hitchhiker  0.000046797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3099  hypothetical protein  50.94 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  35.64 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1019  hypothetical protein  36.05 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  39.53 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  57.14 
 
 		 82 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  57.14 
 
 		 82 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1214  hypothetical protein  44.07 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.314538 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  55.26 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2262  hypothetical protein  51.16 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.490348 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3519  hypothetical protein  51.16 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0169675  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0265  hypothetical protein  48.89 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2436  hypothetical protein  48.84 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  37.04 
 
 		 89 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  39.06 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  34.12 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  34.12 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2475  hypothetical protein  36.9 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.683905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  32.1 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0642  hypothetical protein  39.44 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.343821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  42.22 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  38.24 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  45 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2669  hypothetical protein  35.38 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.562378  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  35.71 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  43.59 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3227  hypothetical protein  40.35 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364796  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3498  hypothetical protein  37.14 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  41.03 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2652  hypothetical protein  38.78 
 
 		 83 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0154  hypothetical protein  37.5 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426804  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  51.43 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  42.55 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  41.03 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  36.62 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  34.78 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0787  CopG/DNA-binding domain-containing protein  39.66 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  33.8 
 
 		 84 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  33.8 
 
 		 84 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>