46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_B2652 on replicon NC_007595
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007595  Synpcc7942_B2652  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  167  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.294685  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  55.22 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  51.56 
 
 
104 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  50.75 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  46.88 
 
 
103 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1185  hypothetical protein  40.96 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.294594 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  41.46 
 
 
104 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  43.75 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  40 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  44.62 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  42.19 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  37.18 
 
 
98 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  39.73 
 
 
101 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1886  hypothetical protein  40.62 
 
 
88 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  39.39 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2436  hypothetical protein  40.98 
 
 
79 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2262  hypothetical protein  42.86 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.490348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1214  hypothetical protein  36.71 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.314538 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  41.1 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  41.1 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  41.1 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  41.1 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3519  hypothetical protein  35.8 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0169675  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1007  hypothetical protein  35.48 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  39.73 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3227  hypothetical protein  36 
 
 
91 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364796  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  39.34 
 
 
85 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2294  hypothetical protein  34.48 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.300358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2071  hypothetical protein  34.48 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000174613  hitchhiker  0.000046797 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2181  hypothetical protein  34.48 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  48.78 
 
 
93 aa  43.5  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2520  hypothetical protein  36.23 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  37.7 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  39.02 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0416  hypothetical protein  38.36 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0543  hypothetical protein  38.78 
 
 
94 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1041  hypothetical protein  38.78 
 
 
94 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144032  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1943  hypothetical protein  38.78 
 
 
94 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  36.49 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2475  hypothetical protein  36.49 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.683905 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  41.03 
 
 
112 aa  40.4  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  41.03 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1019  hypothetical protein  31.34 
 
 
106 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3099  hypothetical protein  40 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>