59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2520 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2520  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  201  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  46.15 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2739  hypothetical protein  46.15 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1943  hypothetical protein  41.3 
 
 		 94 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0543  hypothetical protein  41.3 
 
 		 94 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1041  hypothetical protein  41.3 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144032  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  41.35 
 
 		 104 aa  67  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  41.76 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  40.66 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  29 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  29 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1019  hypothetical protein  54.35 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  36.47 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1702  phage protein  32.18 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18489 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1693  phage protein  32.18 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0612931 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2475  hypothetical protein  48.44 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.683905 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  40 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1185  hypothetical protein  41.82 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.294594 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  39.74 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  52.17 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  54.35 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  48 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  50 
 
 		 103 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  47.73 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  46.81 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  35.71 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  36.36 
 
 		 105 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1886  hypothetical protein  42.55 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  34.67 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0642  hypothetical protein  37.84 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.343821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2868  hypothetical protein  39.34 
 
 		 96 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  31.94 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3099  hypothetical protein  34.85 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  32.39 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  32.39 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  34.34 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0416  hypothetical protein  32.95 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1214  hypothetical protein  42.11 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.314538 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3227  hypothetical protein  47.83 
 
 		 91 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364796  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  32 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  32 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0265  hypothetical protein  35.21 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  29.11 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2181  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2071  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000174613  hitchhiker  0.000046797 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2294  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.300358  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2652  hypothetical protein  36.23 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3498  hypothetical protein  52.17 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1774  hypothetical protein  48.65 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  38.46 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  43.59 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  43.9 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  50 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  41.03 
 
 		 85 aa  40.8  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  34.57 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2669  hypothetical protein  30.51 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.562378  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  30.38 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>