68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1886 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1886  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  182  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  55.81 
 
 
90 aa  95.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  55.68 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  55.68 
 
 
90 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  66.18 
 
 
82 aa  85.9  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  66.18 
 
 
82 aa  85.9  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  55.38 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  45.21 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  47.22 
 
 
98 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  46.58 
 
 
104 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2436  hypothetical protein  50.75 
 
 
79 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1041  hypothetical protein  58.33 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144032  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0543  hypothetical protein  58.33 
 
 
94 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1943  hypothetical protein  58.33 
 
 
94 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  46.15 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3519  hypothetical protein  47.76 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0169675  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1702  phage protein  58.7 
 
 
101 aa  60.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18489 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  55.32 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2294  hypothetical protein  37.8 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.300358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2071  hypothetical protein  37.8 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000174613  hitchhiker  0.000046797 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2181  hypothetical protein  37.8 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  42.86 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1693  phage protein  56.52 
 
 
101 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0612931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  56.82 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  43.42 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  52 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2262  hypothetical protein  47.54 
 
 
69 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.490348 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  53.19 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1185  hypothetical protein  59.52 
 
 
116 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.294594 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  40 
 
 
85 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  55.32 
 
 
100 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  55.32 
 
 
100 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  53.19 
 
 
112 aa  57.4  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  53.19 
 
 
112 aa  57.4  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  34.83 
 
 
113 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2739  hypothetical protein  51.02 
 
 
95 aa  57  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2868  hypothetical protein  56.82 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1007  hypothetical protein  38.36 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2652  hypothetical protein  40.62 
 
 
83 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.294685  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  38.03 
 
 
85 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2520  hypothetical protein  42.55 
 
 
99 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1019  hypothetical protein  39.29 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3099  hypothetical protein  50 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  43.04 
 
 
101 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  34.83 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  43.64 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  48.84 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  43.75 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  32.5 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  42.22 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  43.24 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  36.11 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  36.11 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  38.36 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  43.18 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0265  hypothetical protein  48.89 
 
 
112 aa  42.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0416  hypothetical protein  53.12 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  36.11 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  33.8 
 
 
91 aa  41.6  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1214  hypothetical protein  38.16 
 
 
92 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.314538 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  37.78 
 
 
106 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2475  hypothetical protein  35.44 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.683905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4374  hypothetical protein  36.62 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00628463  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5333  hypothetical protein  33.78 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.583996 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  31.94 
 
 
85 aa  40.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  39.53 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  39.53 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  39.53 
 
 
89 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0480188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>