91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_B2639 on replicon NC_007595
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  220  4e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  44.25 
 
 
104 aa  82  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1041  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144032  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0543  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1943  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  44.83 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  44.83 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1702  phage protein  48.28 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18489 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1693  phage protein  51.32 
 
 
101 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0612931 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  36.11 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  47.37 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  42.39 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  42.39 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2739  hypothetical protein  63.04 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  45.33 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1886  hypothetical protein  55.32 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2294  hypothetical protein  51.02 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.300358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2071  hypothetical protein  51.02 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000174613  hitchhiker  0.000046797 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2181  hypothetical protein  51.02 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1019  hypothetical protein  35.11 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  50.82 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1214  hypothetical protein  52.54 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.314538 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  60.98 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  50 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  50.85 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  58.7 
 
 
90 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3099  hypothetical protein  47.62 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  58.7 
 
 
90 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  56.82 
 
 
105 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  38.96 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1185  hypothetical protein  56.1 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.294594 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  42.5 
 
 
101 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2652  hypothetical protein  44.62 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.294685  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2262  hypothetical protein  53.49 
 
 
69 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.490348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  38.82 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  36.73 
 
 
101 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  36.51 
 
 
109 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2436  hypothetical protein  51.16 
 
 
79 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0287  hypothetical protein  30.39 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0416  hypothetical protein  38.38 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3519  hypothetical protein  41.1 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0169675  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2520  hypothetical protein  31.94 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  34.67 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  58.54 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  58.54 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  38.81 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  38.2 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  38.71 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  45.95 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  52.27 
 
 
98 aa  47.8  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  35.29 
 
 
98 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  35.14 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2868  hypothetical protein  46.43 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2867  hypothetical protein  41.51 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245233  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3498  hypothetical protein  41.07 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1774  hypothetical protein  51.52 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2605  hypothetical protein  51.52 
 
 
80 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0504919  hitchhiker  0.00914648 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  35.82 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2922  hypothetical protein  38.1 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  35.82 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2595  hypothetical protein  51.52 
 
 
79 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0610433  normal  0.1614 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  45 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1580  hypothetical protein  52.94 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.948957  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1007  hypothetical protein  38.89 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  36.51 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  32.5 
 
 
101 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  36.59 
 
 
93 aa  44.7  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  45.95 
 
 
109 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  45.95 
 
 
109 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  45.95 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0787  CopG/DNA-binding domain-containing protein  46.15 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0265  hypothetical protein  51.11 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2220  hypothetical protein  41.54 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  43.59 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0642  hypothetical protein  30.65 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.343821  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0154  hypothetical protein  46 
 
 
81 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426804  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5509  hypothetical protein  49.02 
 
 
102 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  42.11 
 
 
114 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4921  hypothetical protein  47.06 
 
 
78 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  37.84 
 
 
92 aa  41.2  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3227  hypothetical protein  43.48 
 
 
91 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364796  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  39.47 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4943  hypothetical protein  51.52 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2194  hypothetical protein  38.89 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4942  hypothetical protein  44.68 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.809996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  34.92 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4935  hypothetical protein  51.52 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3915  hypothetical protein  51.72 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0518092  normal  0.105053 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  35.14 
 
 
92 aa  40.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  45.71 
 
 
79 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>