44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1580 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1580  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  162  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.948957  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2922  hypothetical protein  70.67 
 
 
81 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2595  hypothetical protein  65.33 
 
 
79 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0610433  normal  0.1614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1774  hypothetical protein  65.33 
 
 
79 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  70.15 
 
 
79 aa  96.7  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2605  hypothetical protein  67.11 
 
 
80 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0504919  hitchhiker  0.00914648 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2867  hypothetical protein  63.16 
 
 
80 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245233  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3632  hypothetical protein  61.97 
 
 
82 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596727  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3915  hypothetical protein  63.77 
 
 
80 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0518092  normal  0.105053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3925  hypothetical protein  53.85 
 
 
82 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5333  hypothetical protein  55.93 
 
 
77 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.583996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3169  hypothetical protein  64.86 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  60.98 
 
 
104 aa  57  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4921  hypothetical protein  50.85 
 
 
78 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  59.38 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1214  hypothetical protein  57.58 
 
 
92 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.314538 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  48.89 
 
 
93 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  57.58 
 
 
101 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  51.52 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  52.94 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2475  hypothetical protein  51.11 
 
 
94 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.683905 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  44.44 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  44.44 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0416  hypothetical protein  51.52 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  38.71 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3498  hypothetical protein  44.44 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  37.5 
 
 
85 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  45.45 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1007  hypothetical protein  48.78 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3227  hypothetical protein  38.71 
 
 
91 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364796  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  35.06 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  46.15 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  45.45 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  47.37 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  50 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  41.46 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  44.44 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0642  hypothetical protein  45.95 
 
 
95 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.343821  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  34.88 
 
 
106 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  53.12 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  45.45 
 
 
112 aa  40  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  45.45 
 
 
112 aa  40  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  40 
 
 
91 aa  40  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  30.77 
 
 
79 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>