32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3632 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3632  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3925  hypothetical protein  98.78 
 
 		 82 aa  160  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3915  hypothetical protein  87.8 
 
 		 80 aa  137  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0518092  normal  0.105053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  58.54 
 
 		 79 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2922  hypothetical protein  60.26 
 
 		 81 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2605  hypothetical protein  60.26 
 
 		 80 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0504919  hitchhiker  0.00914648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1580  hypothetical protein  61.97 
 
 		 80 aa  84.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.948957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1774  hypothetical protein  54.55 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2867  hypothetical protein  57.69 
 
 		 80 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2595  hypothetical protein  54.55 
 
 		 79 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0610433  normal  0.1614 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5333  hypothetical protein  49.32 
 
 		 77 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.583996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3169  hypothetical protein  67.09 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4921  hypothetical protein  45.21 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  48.89 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  46.51 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  48.84 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  47.22 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  47.22 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0642  hypothetical protein  48.65 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.343821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0416  hypothetical protein  51.35 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  38.36 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1214  hypothetical protein  47.37 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.314538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  36.99 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  36.99 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3227  hypothetical protein  44.44 
 
 		 91 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364796  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  37.21 
 
 		 105 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  39.53 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  39.53 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  39.13 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  36.84 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>