74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3975 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  53.52 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0287  hypothetical protein  55.22 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  66.67 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  43.42 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  38.57 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  44.29 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  44.29 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  44.12 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  58 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  46.38 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  49.18 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  43.48 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  57.45 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  55.56 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  55.56 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  47.27 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2220  hypothetical protein  44.44 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  39.68 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  52.17 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2273  hypothetical protein  52.63 
 
 		 90 aa  50.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  36.71 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  44.68 
 
 		 143 aa  50.1  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  39.68 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4942  hypothetical protein  44.83 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.809996 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4935  hypothetical protein  44.83 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  58.82 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4943  hypothetical protein  40.68 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2605  hypothetical protein  47.62 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0504919  hitchhiker  0.00914648 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  51.28 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2867  hypothetical protein  50 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2739  hypothetical protein  38.89 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  46.81 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  55.88 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  47.5 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  36.9 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  47.5 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1774  hypothetical protein  47.22 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3915  hypothetical protein  44.74 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0518092  normal  0.105053 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2536  hypothetical protein  47.37 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1019  hypothetical protein  46.67 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  51.35 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1281  hypothetical protein  52.78 
 
 		 90 aa  43.5  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  32.14 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3907  putative cytoplasmic protein  51.61 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  36.26 
 
 		 98 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  38 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2595  hypothetical protein  44.74 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0610433  normal  0.1614 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  38 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  51.43 
 
 		 105 aa  42.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  33.73 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1995  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0383118 
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  34.52 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2922  hypothetical protein  47.22 
 
 		 81 aa  42  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  52.78 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  52.78 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5333  hypothetical protein  41.46 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.583996 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0642  hypothetical protein  34.92 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.343821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1968  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  51.43 
 
 		 104 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  34.67 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4921  hypothetical protein  48.57 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3632  hypothetical protein  36.84 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2194  hypothetical protein  42.22 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3925  hypothetical protein  36.84 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0416  hypothetical protein  33.73 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1008  hypothetical protein  39.34 
 
 		 83 aa  40  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  30 
 
 		 104 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  45.71 
 
 		 109 aa  40  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1580  hypothetical protein  30.77 
 
 		 80 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.948957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>