56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1281 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1281  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  182  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2220  hypothetical protein  51.9 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  48.75 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  44.87 
 
 		 84 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2273  hypothetical protein  52.86 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4943  hypothetical protein  48.75 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3352  hypothetical protein  44.74 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4942  hypothetical protein  45 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.809996 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4935  hypothetical protein  45 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  47.3 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  47.44 
 
 		 98 aa  67  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  52.31 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  46.84 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  44.78 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  43.94 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3907  putative cytoplasmic protein  41.33 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  32.47 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  39.73 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1806  hypothetical protein  41.38 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.832852  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  38.33 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  36.67 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  29.59 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  38.33 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  61.76 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  32.53 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  30.26 
 
 		 91 aa  47.8  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  34.18 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  45 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  32.47 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  31.58 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  39.34 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  51.43 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4374  hypothetical protein  36.36 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00628463  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  32.22 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  32.22 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3227  hypothetical protein  52.78 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364796  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  52.78 
 
 		 79 aa  43.5  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1995  hypothetical protein  34.29 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0383118 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1968  hypothetical protein  34.29 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4921  hypothetical protein  40 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  48.57 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  39.58 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  35.63 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  39.29 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  39.29 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  48.57 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  32.35 
 
 		 90 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1214  hypothetical protein  40 
 
 		 92 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.314538 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  32.91 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2536  hypothetical protein  38.98 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  33.85 
 
 		 101 aa  40.4  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  32.91 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1019  hypothetical protein  45.71 
 
 		 106 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>