37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1968 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1995  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0383118 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1968  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4374  hypothetical protein  47.73 
 
 
88 aa  93.6  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00628463  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0524  hypothetical protein  51.16 
 
 
110 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0112634  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  44.58 
 
 
84 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  48.1 
 
 
98 aa  82  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  44.3 
 
 
84 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  44.3 
 
 
84 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  43.37 
 
 
85 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2536  hypothetical protein  41.03 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  39.74 
 
 
85 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  40.51 
 
 
84 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  36.47 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  45.59 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  40.54 
 
 
91 aa  54.3  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  36.62 
 
 
106 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  30.12 
 
 
98 aa  53.9  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4943  hypothetical protein  38.16 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  30.12 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  33.33 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  30.53 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3907  putative cytoplasmic protein  35.06 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3352  hypothetical protein  31.91 
 
 
100 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  34.48 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  30.49 
 
 
114 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  31.4 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  50 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1281  hypothetical protein  34.29 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  33.33 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4935  hypothetical protein  33.77 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4942  hypothetical protein  32.93 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.809996 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  29.33 
 
 
89 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  47.06 
 
 
92 aa  41.6  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  27.06 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  35.62 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4135  hypothetical protein  75 
 
 
54 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  30 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.633905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>