51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6776 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  202  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  45.78 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  42.86 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  39.77 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  45.78 
 
 		 85 aa  67  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  37.8 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  41.46 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  42.31 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  37.21 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4935  hypothetical protein  38.71 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  38.75 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0287  hypothetical protein  37.8 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  35.63 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  35.63 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  43.55 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4942  hypothetical protein  37.63 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.809996 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  37.78 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  42.31 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  37.18 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  39.56 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2273  hypothetical protein  46.15 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  37.18 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4374  hypothetical protein  39.51 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00628463  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2220  hypothetical protein  38.2 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  37.18 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  35.71 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  34.48 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4943  hypothetical protein  38.55 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  38.82 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2536  hypothetical protein  32.47 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1968  hypothetical protein  30.12 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1995  hypothetical protein  30.12 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0383118 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0524  hypothetical protein  32.58 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0112634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  36.96 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  36.96 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  44.9 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3907  putative cytoplasmic protein  35.53 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  40.32 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0612  hypothetical protein  45.65 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0628  hypothetical protein  45.65 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1041  hypothetical protein  42.55 
 
 		 94 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144032  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0543  hypothetical protein  42.55 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  34.52 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1943  hypothetical protein  42.55 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  43.48 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  43.48 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  47.06 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  28.26 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1314  CopG domain protein DNA-binding domain protein  41.67 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153702 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  32.29 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>