41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3907 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3907  putative cytoplasmic protein  100 
 
 		 92 aa  187  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  53.85 
 
 		 105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4943  hypothetical protein  57.5 
 
 		 100 aa  107  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4935  hypothetical protein  51.19 
 
 		 98 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4942  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.809996 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2220  hypothetical protein  47.5 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2273  hypothetical protein  47.14 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  50.62 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  46.25 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3352  hypothetical protein  39.02 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  43.75 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  43.75 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  42.31 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  47.3 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1281  hypothetical protein  41.33 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  43.84 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  41.1 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  35.53 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  38.75 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  35 
 
 		 84 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  35 
 
 		 84 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  39.02 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  35.44 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  34.18 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  40.74 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1995  hypothetical protein  35.06 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0383118 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1968  hypothetical protein  35.06 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2536  hypothetical protein  42.19 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  35.53 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  51.61 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  54.55 
 
 		 93 aa  43.5  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4374  hypothetical protein  37.14 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00628463  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  27.96 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  40.35 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0287  hypothetical protein  48.57 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  36.25 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1806  hypothetical protein  58.06 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.832852  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  33.33 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  33.33 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>