46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4374 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4374  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  180  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00628463  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0524  hypothetical protein  60.71 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0112634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1995  hypothetical protein  47.73 
 
 		 88 aa  93.6  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0383118 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1968  hypothetical protein  47.73 
 
 		 88 aa  93.6  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  48.84 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  48.68 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  46.05 
 
 		 85 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2536  hypothetical protein  45.83 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  43.42 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  45.21 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  54.69 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  40.74 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  44.12 
 
 		 84 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  42.11 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  35.35 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  41.1 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  39.51 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  37.04 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  34.12 
 
 		 105 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  32.61 
 
 		 104 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  39.74 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  39.74 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  28.41 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  41.33 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  41.33 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1281  hypothetical protein  36.36 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2273  hypothetical protein  39.71 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3352  hypothetical protein  34.94 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3907  putative cytoplasmic protein  37.14 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4943  hypothetical protein  36.11 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  30.12 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  54.84 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  51.61 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2220  hypothetical protein  36.36 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  28.4 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1886  hypothetical protein  36.62 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  35.11 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  35.11 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4942  hypothetical protein  34.78 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.809996 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>