37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3352 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3352  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  207  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2220  hypothetical protein  48.75 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4943  hypothetical protein  37.63 
 
 
100 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1281  hypothetical protein  44.74 
 
 
90 aa  69.3  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3907  putative cytoplasmic protein  39.02 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  46.15 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4935  hypothetical protein  36.46 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4942  hypothetical protein  36.46 
 
 
100 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.809996 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2273  hypothetical protein  45.95 
 
 
90 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  44.58 
 
 
84 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  44.58 
 
 
84 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  42.5 
 
 
84 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  40.62 
 
 
85 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  40.91 
 
 
85 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  46.15 
 
 
84 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  45.16 
 
 
98 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  45.07 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  46.48 
 
 
98 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  41.25 
 
 
91 aa  53.5  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  42.68 
 
 
106 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  38.1 
 
 
114 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  39.51 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1995  hypothetical protein  31.91 
 
 
88 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0383118 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1968  hypothetical protein  31.91 
 
 
88 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2489  hypothetical protein  34.12 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.394222  normal  0.792208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  41.56 
 
 
104 aa  43.5  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4374  hypothetical protein  34.94 
 
 
88 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00628463  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  32.97 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  34 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  40.51 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  32.97 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  41.77 
 
 
105 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  41.38 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  38.03 
 
 
109 aa  40.8  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  36.17 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  34.74 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  40.51 
 
 
104 aa  40.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>