78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0692 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  205  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  56.79 
 
 
96 aa  97.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  56.41 
 
 
84 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  57.69 
 
 
85 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  60.27 
 
 
84 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  53.85 
 
 
84 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  53.85 
 
 
84 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4374  hypothetical protein  48.84 
 
 
88 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00628463  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  51.85 
 
 
85 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  50.63 
 
 
98 aa  85.5  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2536  hypothetical protein  55.13 
 
 
108 aa  85.1  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1968  hypothetical protein  48.1 
 
 
88 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1995  hypothetical protein  48.1 
 
 
88 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0383118 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0524  hypothetical protein  43.59 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0112634  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  50 
 
 
105 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  53.16 
 
 
106 aa  77.8  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  56.58 
 
 
91 aa  76.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  52.78 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  39.18 
 
 
104 aa  71.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2273  hypothetical protein  45.33 
 
 
90 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  44.94 
 
 
114 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  48 
 
 
85 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1281  hypothetical protein  52.31 
 
 
90 aa  67  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2220  hypothetical protein  45.21 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4943  hypothetical protein  47.3 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  41.46 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3907  putative cytoplasmic protein  47.3 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4935  hypothetical protein  44.59 
 
 
98 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  44.12 
 
 
79 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4942  hypothetical protein  44.59 
 
 
100 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.809996 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  47.76 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  47.76 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  47.06 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  35.8 
 
 
93 aa  57  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  64.71 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3352  hypothetical protein  46.48 
 
 
100 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0287  hypothetical protein  38.75 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  61.76 
 
 
92 aa  54.7  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  35.87 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  36.26 
 
 
90 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  36.26 
 
 
90 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  37.65 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  41.33 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  41.33 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1019  hypothetical protein  34.04 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  61.76 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  35.29 
 
 
109 aa  47  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  36.36 
 
 
90 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  53.85 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3519  hypothetical protein  42.65 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0169675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0543  hypothetical protein  38.24 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1041  hypothetical protein  38.24 
 
 
94 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  32.63 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  30.85 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1943  hypothetical protein  38.24 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  50 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  29.47 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1314  CopG domain protein DNA-binding domain protein  50 
 
 
80 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153702 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1008  hypothetical protein  45.28 
 
 
83 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  31.52 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  39.08 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  31.63 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  39.08 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2436  hypothetical protein  41.18 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1886  hypothetical protein  38.36 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  51.52 
 
 
112 aa  42.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  51.52 
 
 
112 aa  42.7  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  36.23 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2046  CopG domain protein DNA-binding domain protein  47.62 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.30352  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2415  hypothetical protein  47.62 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.612018  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2181  hypothetical protein  47.37 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2071  hypothetical protein  47.37 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000174613  hitchhiker  0.000046797 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2294  hypothetical protein  47.37 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.300358  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  43.75 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1774  hypothetical protein  57.14 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4921  hypothetical protein  48.72 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  35.19 
 
 
104 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2868  hypothetical protein  26.83 
 
 
96 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>