63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3519 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3519  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  186  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0169675  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2436  hypothetical protein  91.14 
 
 		 79 aa  146  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2262  hypothetical protein  80 
 
 		 69 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.490348 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  53.95 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  53.95 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  56.52 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  56.52 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  48.61 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1886  hypothetical protein  47.76 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  46.05 
 
 		 101 aa  60.1  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  42.03 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  37.66 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3498  hypothetical protein  40.91 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2071  hypothetical protein  48.44 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000174613  hitchhiker  0.000046797 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2181  hypothetical protein  48.44 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2294  hypothetical protein  48.44 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.300358  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  35.53 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  38.96 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  42.65 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1185  hypothetical protein  55.56 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.294594 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  41.18 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1943  hypothetical protein  51.16 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0543  hypothetical protein  51.16 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1041  hypothetical protein  51.16 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144032  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  39.24 
 
 		 104 aa  50.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  39.51 
 
 		 105 aa  50.1  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  53.33 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0642  hypothetical protein  40.79 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.343821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  41.1 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  43.04 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  41.82 
 
 		 105 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  51.16 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  40.54 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  51.16 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  38.27 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1702  phage protein  47.92 
 
 		 101 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18489 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  39.74 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  36 
 
 		 84 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  36 
 
 		 84 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  42.65 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2652  hypothetical protein  35.8 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  37.5 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  42.65 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3227  hypothetical protein  38.46 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364796  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0416  hypothetical protein  39.74 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  42.65 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  37.5 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  44.9 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  36 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  43.04 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1693  phage protein  44.9 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0612931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  48.94 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  38.24 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2536  hypothetical protein  36.99 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2739  hypothetical protein  35.29 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  40.48 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  38.57 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3099  hypothetical protein  47.62 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  38.1 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  48.65 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1214  hypothetical protein  37.5 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.314538 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  35.29 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  47.5 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>