46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3498 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3498  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3227  hypothetical protein  57.14 
 
 		 91 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364796  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  56.34 
 
 		 105 aa  87  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0416  hypothetical protein  56.34 
 
 		 105 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2475  hypothetical protein  54.43 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.683905 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  45.65 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  54.79 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3099  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  49.35 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  48.61 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2294  hypothetical protein  43.42 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.300358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2071  hypothetical protein  43.42 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000174613  hitchhiker  0.000046797 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2181  hypothetical protein  43.42 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  45.95 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  39.18 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  61.22 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2868  hypothetical protein  43.42 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3519  hypothetical protein  40.91 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0169675  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1214  hypothetical protein  40.79 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.314538 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2436  hypothetical protein  54 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  40 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2262  hypothetical protein  54 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.490348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1185  hypothetical protein  42.67 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.294594 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2739  hypothetical protein  51.11 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  44.44 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  47.46 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  37.97 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  35.44 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  41.07 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  41.56 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  35.53 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  35.53 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1580  hypothetical protein  44.44 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.948957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1774  hypothetical protein  54.55 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2520  hypothetical protein  52.17 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  42.62 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1702  phage protein  40.82 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18489 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0543  hypothetical protein  37.14 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  38.75 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1041  hypothetical protein  37.14 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144032  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1943  hypothetical protein  37.14 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0642  hypothetical protein  35.71 
 
 		 95 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.343821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2922  hypothetical protein  47.06 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1019  hypothetical protein  44.68 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  37.5 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  37.5 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>