24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0524 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0524  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  226  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0112634  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4374  hypothetical protein  60.71 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00628463  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1995  hypothetical protein  51.16 
 
 
88 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0383118 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1968  hypothetical protein  51.16 
 
 
88 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  43.59 
 
 
98 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  40.48 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  40.48 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  40.24 
 
 
84 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2536  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  37.8 
 
 
85 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  35.37 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  36.9 
 
 
85 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  42.65 
 
 
84 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  35.9 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  32.14 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  34.12 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  33.73 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  32.58 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  34.07 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  42.86 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  34.21 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4943  hypothetical protein  35.48 
 
 
100 aa  41.2  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  32.56 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0165721 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>