54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4935 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4935  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4942  hypothetical protein  98.98 
 
 
100 aa  199  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.809996 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4943  hypothetical protein  83.67 
 
 
100 aa  173  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  56.32 
 
 
105 aa  110  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3907  putative cytoplasmic protein  51.19 
 
 
92 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2220  hypothetical protein  50.57 
 
 
106 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2273  hypothetical protein  53.52 
 
 
90 aa  87.4  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  46.75 
 
 
98 aa  70.5  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  42.68 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1281  hypothetical protein  45 
 
 
90 aa  67.8  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  41.03 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3352  hypothetical protein  36.46 
 
 
100 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  45.45 
 
 
85 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  38.2 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  41.03 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  38.71 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  41.03 
 
 
85 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  44.59 
 
 
98 aa  60.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  40.74 
 
 
106 aa  60.5  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  37.8 
 
 
84 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  37.8 
 
 
84 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  39.47 
 
 
84 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  50 
 
 
105 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2536  hypothetical protein  43.08 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  53.66 
 
 
92 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  33.77 
 
 
114 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  51.22 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  44.83 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2489  hypothetical protein  34.74 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.394222  normal  0.792208 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  45.45 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  32.26 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1968  hypothetical protein  33.77 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  35 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1995  hypothetical protein  33.77 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0383118 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1314  CopG domain protein DNA-binding domain protein  41.51 
 
 
80 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153702 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  39.62 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  33.78 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1806  hypothetical protein  62.96 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.832852  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0287  hypothetical protein  32.61 
 
 
107 aa  40.8  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  30.69 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  36 
 
 
103 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  43.9 
 
 
100 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  43.9 
 
 
100 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  48.57 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  46.34 
 
 
90 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  46.34 
 
 
90 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  51.52 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  48.72 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  48.72 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  51.52 
 
 
112 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  51.52 
 
 
112 aa  40  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1943  hypothetical protein  39.71 
 
 
94 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0543  hypothetical protein  39.71 
 
 
94 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>