58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1361 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  191  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0287  hypothetical protein  74.44 
 
 		 107 aa  143  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  53.52 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  40.22 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  37.8 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  41.18 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  36.08 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  37.65 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  43.59 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  35.8 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  51.02 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  35.9 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  42.25 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  42.25 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  35.8 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  40.58 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  38.16 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  31.71 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  44.9 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  64.71 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  42.55 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  31.82 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  61.76 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  29.27 
 
 		 84 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  29.27 
 
 		 84 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  30.16 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4374  hypothetical protein  28.41 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00628463  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  45 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  42.5 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  42.5 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2273  hypothetical protein  40.48 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  42.5 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  36.59 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  42.5 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1774  hypothetical protein  43.48 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2536  hypothetical protein  43.9 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3907  putative cytoplasmic protein  54.55 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2181  hypothetical protein  43.59 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1281  hypothetical protein  39.58 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2071  hypothetical protein  43.59 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000174613  hitchhiker  0.000046797 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2294  hypothetical protein  43.59 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.300358  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2220  hypothetical protein  32.79 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4943  hypothetical protein  43.75 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  40.54 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  58.62 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2194  hypothetical protein  36.36 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2262  hypothetical protein  46.34 
 
 		 69 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.490348 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4935  hypothetical protein  39.62 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4942  hypothetical protein  41.86 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.809996 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2867  hypothetical protein  50 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2605  hypothetical protein  50 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0504919  hitchhiker  0.00914648 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2595  hypothetical protein  39.13 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0610433  normal  0.1614 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  28.36 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  39.47 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  28.36 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2520  hypothetical protein  30.38 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>