19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2194 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2194  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  256  6e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  36.84 
 
 		 143 aa  50.1  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  42.42 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  42.42 
 
 		 109 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  42.42 
 
 		 109 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  42.59 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  48.89 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0287  hypothetical protein  28.57 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  48.89 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  40 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  40.38 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  36.36 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  51.28 
 
 		 84 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  51.35 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  38.89 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  51.35 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  42.22 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  54.84 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  43.9 
 
 		 104 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>