47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5333 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5333  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.583996 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4921  hypothetical protein  65.79 
 
 		 78 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2867  hypothetical protein  58.44 
 
 		 80 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2605  hypothetical protein  57.14 
 
 		 80 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0504919  hitchhiker  0.00914648 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1774  hypothetical protein  57.89 
 
 		 79 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2922  hypothetical protein  56.58 
 
 		 81 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  52.63 
 
 		 79 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2595  hypothetical protein  52.63 
 
 		 79 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0610433  normal  0.1614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3915  hypothetical protein  52.11 
 
 		 80 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0518092  normal  0.105053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3632  hypothetical protein  49.32 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1580  hypothetical protein  55.93 
 
 		 80 aa  67  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.948957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3925  hypothetical protein  46.58 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  53.33 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3169  hypothetical protein  69.7 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  48.84 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  55.56 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  57.14 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  52.38 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0416  hypothetical protein  57.14 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  52.78 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  52.78 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  41.46 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  44 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3227  hypothetical protein  51.52 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364796  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1214  hypothetical protein  52.94 
 
 		 92 aa  43.5  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.314538 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  42.22 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  44.74 
 
 		 100 aa  42.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  44.74 
 
 		 100 aa  42.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  47.62 
 
 		 104 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2071  hypothetical protein  44.44 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000174613  hitchhiker  0.000046797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  47.62 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2294  hypothetical protein  44.44 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.300358  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2181  hypothetical protein  44.44 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  43.59 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  51.43 
 
 		 85 aa  42  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  41.46 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  47.37 
 
 		 101 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  51.43 
 
 		 85 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  48.84 
 
 		 113 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1886  hypothetical protein  33.78 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  34.92 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  44.44 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  44.44 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  39.22 
 
 		 105 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  40  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1693  phage protein  36.96 
 
 		 101 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0612931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>