19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0787 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0787  CopG/DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 
82 aa  165  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0264  hypothetical protein  56.1 
 
 
84 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1314  CopG domain protein DNA-binding domain protein  57.69 
 
 
80 aa  90.9  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153702 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0154  hypothetical protein  56.96 
 
 
81 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426804  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1008  hypothetical protein  57.14 
 
 
83 aa  90.1  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2046  CopG domain protein DNA-binding domain protein  56.41 
 
 
80 aa  90.1  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.30352  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2415  hypothetical protein  56.41 
 
 
80 aa  90.1  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.612018  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1870  hypothetical protein  56.25 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530557  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2757  hypothetical protein  42.11 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  42.62 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2489  hypothetical protein  42.11 
 
 
121 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.394222  normal  0.792208 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  46.15 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0130  hypothetical protein  43.86 
 
 
70 aa  42  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2196  hypothetical protein  43.86 
 
 
70 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1041  hypothetical protein  39.66 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144032  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0543  hypothetical protein  39.66 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1943  hypothetical protein  39.66 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  44 
 
 
90 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  44 
 
 
90 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>