57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0265 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0265  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  223  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5509  hypothetical protein  64.29 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  56.6 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1185  hypothetical protein  48.28 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.294594 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  50.91 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  62.79 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  49.15 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  54.9 
 
 		 82 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  54.9 
 
 		 82 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  54.9 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  40.24 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  50.98 
 
 		 100 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  50.98 
 
 		 100 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3671  helix-turn-helix domain-containing protein  60.87 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.179939  normal  0.801246 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2868  hypothetical protein  54.76 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  54.55 
 
 		 105 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  54.17 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2475  hypothetical protein  50.94 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.683905 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1041  hypothetical protein  48.89 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144032  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0543  hypothetical protein  48.89 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1019  hypothetical protein  40.35 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1943  hypothetical protein  48.89 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  61.11 
 
 		 101 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  50 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  45.83 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  52.38 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  44 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3227  hypothetical protein  46.15 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364796  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2520  hypothetical protein  35.21 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1702  phage protein  43.1 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18489 
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3099  hypothetical protein  45.24 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1214  hypothetical protein  45.61 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.314538 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  43.75 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1693  phage protein  45.1 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0612931 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  51.11 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1886  hypothetical protein  48.89 
 
 		 88 aa  42.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  41.51 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  38.1 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  38.1 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2181  hypothetical protein  45.65 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2071  hypothetical protein  45.65 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000174613  hitchhiker  0.000046797 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2294  hypothetical protein  45.65 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.300358  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  44.9 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  42 
 
 		 84 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2273  hypothetical protein  45.45 
 
 		 90 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  57.58 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0416  hypothetical protein  47.62 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  57.58 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  56.25 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  40 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  40 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  43.59 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2262  hypothetical protein  44.44 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.490348 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0642  hypothetical protein  43.48 
 
 		 95 aa  40  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.343821  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>