57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2905 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2905  anti sigma-E protein, RseA  100 
 
 		 209 aa  411  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131294  normal  0.588915 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1079  anti sigma-E protein, RseA  92.38 
 
 		 214 aa  332  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1795  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  66.51 
 
 		 200 aa  234  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0537  sigma factor algU regulatory protein MucA, putative  66.51 
 
 		 200 aa  234  8e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587813  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2809  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  66.51 
 
 		 200 aa  234  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2472  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  66.51 
 
 		 200 aa  234  8e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0835  anti sigma-E protein, RseA  71.16 
 
 		 217 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2176  anti sigma-E protein, RseA  66.98 
 
 		 209 aa  229  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1086  anti sigma-E protein, RseA  68.08 
 
 		 205 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4240  anti sigma-E protein, RseA  67.77 
 
 		 209 aa  218  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0648  anti sigma-E protein, RseA  67.61 
 
 		 205 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1128  anti sigma-E protein, RseA  67.61 
 
 		 205 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1008  anti sigma-E protein, RseA  68.54 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1004  anti sigma-E protein, RseA  68.08 
 
 		 209 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59721  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2900  putative sigma E factor negative regulatory protein  66.98 
 
 		 200 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2785  sigma factor negative regulatory protein RseA family  66.98 
 
 		 200 aa  197  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1724  sigma factor algU regulatory protein MucA, putative  69.34 
 
 		 200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2847  sigma factor negative regulatory protein RseA family  66.51 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2424  anti sigma-E protein RseA  43.37 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0241315  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0986  anti sigma-E protein, RseA  37.56 
 
 		 210 aa  88.2  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.99218  normal  0.105676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0921  anti sigma-E protein, RseA  37.96 
 
 		 210 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1056  putative transmembrane sigma-E factor negative regulatory transcription regulator protein  40.72 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.640083 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0643  putative transmembrane sigma-E factor negative regulatory transcription regulator protein  40.43 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483517  normal  0.192651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2258  anti sigma-E protein RseA, N-terminal  39.06 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14596  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1396  anti sigma-E protein, RseA  35.21 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0604  anti sigma-E protein, RseA  49.38 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000998375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1737  anti sigma-E protein RseA  29.41 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.27797  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1190  anti sigma-E protein, RseA  30.11 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2094  hypothetical protein  32 
 
 		 185 aa  52.4  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2320  anti sigma-E protein, RseA  28.64 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3273  anti sigma-E protein, RseA  54 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221066  normal  0.389812 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1130  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  38.82 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0835394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3605  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  38.82 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1183  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  38.82 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.013522  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2626  anti sigma-E protein, RseA  54 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1001  hypothetical protein  34.82 
 
 		 152 aa  49.3  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000551436  normal  0.0534143 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0857  hypothetical protein  34.82 
 
 		 152 aa  49.3  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000656151  normal  0.0292756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3245  anti sigma-E protein, RseA  31.9 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0106156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5266  anti sigma-E protein, RseA  28.91 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1955  anti sigma-E protein, RseA  39.51 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.17101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3067  anti sigma-E protein, RseA  26.76 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1238  anti sigma-E protein, RseA  32.48 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  hitchhiker  0.000016477 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3076  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  36.9 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03004  sigma E factor negative regulatory protein  32.5 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000104039  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1747  anti sigma-E protein RseA  29.47 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1199  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  35.71 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000199919  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3809  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  34.94 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0371131  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1096  anti sigma-E protein, RseA  34.94 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.076128  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02430  hypothetical protein  34.94 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2937  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  34.94 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.339714  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2725  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  34.94 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.07615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1105  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  34.94 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2858  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  34.94 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0465052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2727  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  34.94 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.246121  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02466  anti-sigma factor  34.94 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2044  sigma-E factor negative regulatory protein RseA  36.49 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1084  anti sigma-E protein, RseA  36.84 
 
 		 196 aa  41.6  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>