42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2258 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2258  anti sigma-E protein RseA, N-terminal  100 
 
 		 212 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14596  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2424  anti sigma-E protein RseA  74.09 
 
 		 218 aa  291  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0241315  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0921  anti sigma-E protein, RseA  54.63 
 
 		 210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0986  anti sigma-E protein, RseA  53.24 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.99218  normal  0.105676 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1056  putative transmembrane sigma-E factor negative regulatory transcription regulator protein  56.28 
 
 		 217 aa  157  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.640083 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0537  sigma factor algU regulatory protein MucA, putative  39.38 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2472  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  39.38 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2809  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  39.38 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1795  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  39.38 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5266  anti sigma-E protein, RseA  34.33 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2176  anti sigma-E protein, RseA  38.97 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1079  anti sigma-E protein, RseA  37.08 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0835  anti sigma-E protein, RseA  37.64 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2785  sigma factor negative regulatory protein RseA family  38.34 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2900  putative sigma E factor negative regulatory protein  38.34 
 
 		 200 aa  72  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1004  anti sigma-E protein, RseA  39.18 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59721  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1008  anti sigma-E protein, RseA  38.66 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2847  sigma factor negative regulatory protein RseA family  37.82 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2905  anti sigma-E protein, RseA  38.02 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131294  normal  0.588915 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0643  putative transmembrane sigma-E factor negative regulatory transcription regulator protein  31.68 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483517  normal  0.192651 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4240  anti sigma-E protein, RseA  37.63 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1190  anti sigma-E protein, RseA  36.87 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1128  anti sigma-E protein, RseA  37.63 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0648  anti sigma-E protein, RseA  37.63 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1086  anti sigma-E protein, RseA  38.46 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2320  anti sigma-E protein, RseA  34.48 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1724  sigma factor algU regulatory protein MucA, putative  37.82 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0604  anti sigma-E protein, RseA  32.56 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000998375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1737  anti sigma-E protein RseA  27.23 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.27797  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3273  anti sigma-E protein, RseA  34.95 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221066  normal  0.389812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3067  anti sigma-E protein, RseA  28.5 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2626  anti sigma-E protein, RseA  31.79 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1396  anti sigma-E protein, RseA  29.32 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1001  hypothetical protein  35.04 
 
 		 152 aa  47.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000551436  normal  0.0534143 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0857  hypothetical protein  35.04 
 
 		 152 aa  47.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000656151  normal  0.0292756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3245  anti sigma-E protein, RseA  33.33 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0106156 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2044  sigma-E factor negative regulatory protein RseA  35.29 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1049  anti sigma-E protein, RseA  28.5 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00135611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0875  sigma-E factor negative regulatory protein  36.71 
 
 		 198 aa  42  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.304231  normal  0.0528979 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002492  sigma factor RpoE negative regulatory protein RseA  31.03 
 
 		 208 aa  42  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0123192  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2094  hypothetical protein  36.99 
 
 		 185 aa  41.6  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3059  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  29.32 
 
 		 216 aa  41.6  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185933  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>