40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1190 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1190  anti sigma-E protein, RseA  100 
 
 		 207 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3273  anti sigma-E protein, RseA  54.29 
 
 		 207 aa  165  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221066  normal  0.389812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2626  anti sigma-E protein, RseA  54.03 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5266  anti sigma-E protein, RseA  43.75 
 
 		 238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3245  anti sigma-E protein, RseA  52.63 
 
 		 202 aa  138  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0106156 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1737  anti sigma-E protein RseA  42.72 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.27797  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3067  anti sigma-E protein, RseA  42.4 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1396  anti sigma-E protein, RseA  43.36 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3642  anti sigma-E protein RseA  40.47 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0643  putative transmembrane sigma-E factor negative regulatory transcription regulator protein  40.69 
 
 		 214 aa  92  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483517  normal  0.192651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2258  anti sigma-E protein RseA, N-terminal  33.9 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14596  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2424  anti sigma-E protein RseA  32.62 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0241315  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1079  anti sigma-E protein, RseA  30.21 
 
 		 214 aa  51.2  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0066  anti sigma-E protein, RseA  29.1 
 
 		 177 aa  51.6  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00955502  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2176  anti sigma-E protein, RseA  30.54 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2905  anti sigma-E protein, RseA  30.05 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131294  normal  0.588915 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0986  anti sigma-E protein, RseA  30.68 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.99218  normal  0.105676 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2472  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  32.62 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2809  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  32.62 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1795  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  32.62 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0537  sigma factor algU regulatory protein MucA, putative  32.62 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587813  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0921  anti sigma-E protein, RseA  31.49 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4240  anti sigma-E protein, RseA  26.24 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1086  anti sigma-E protein, RseA  29.41 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1008  anti sigma-E protein, RseA  27.09 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1128  anti sigma-E protein, RseA  26.6 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1004  anti sigma-E protein, RseA  27.94 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59721  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0648  anti sigma-E protein, RseA  26.6 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02430  hypothetical protein  39.76 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2937  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  39.76 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.339714  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3809  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  39.76 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0371131  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02466  anti-sigma factor  39.76 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0835  anti sigma-E protein, RseA  28.71 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0604  anti sigma-E protein, RseA  30.58 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000998375 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2725  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  39.76 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.07615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1105  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  39.76 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2858  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  39.76 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0465052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2727  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  39.76 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.246121  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1096  anti sigma-E protein, RseA  39.76 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.076128  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1056  putative transmembrane sigma-E factor negative regulatory transcription regulator protein  31.55 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.640083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>