26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3642 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3642  anti sigma-E protein RseA  100 
 
 		 199 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3067  anti sigma-E protein, RseA  63.37 
 
 		 213 aa  230  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1737  anti sigma-E protein RseA  45.15 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.27797  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1190  anti sigma-E protein, RseA  40.47 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0643  putative transmembrane sigma-E factor negative regulatory transcription regulator protein  40 
 
 		 214 aa  104  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483517  normal  0.192651 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1396  anti sigma-E protein, RseA  37.5 
 
 		 222 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3273  anti sigma-E protein, RseA  40.38 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221066  normal  0.389812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2626  anti sigma-E protein, RseA  38.46 
 
 		 207 aa  94.7  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3245  anti sigma-E protein, RseA  41.06 
 
 		 202 aa  89.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0106156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5266  anti sigma-E protein, RseA  33.78 
 
 		 238 aa  88.6  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0604  anti sigma-E protein, RseA  31.48 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000998375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0921  anti sigma-E protein, RseA  30.05 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2424  anti sigma-E protein RseA  39.71 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0241315  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2094  hypothetical protein  37.31 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0986  anti sigma-E protein, RseA  28.57 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.99218  normal  0.105676 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2472  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  30.39 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2809  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  30.39 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1795  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  30.39 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0537  sigma factor algU regulatory protein MucA, putative  30.39 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587813  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2465  anti sigma-E protein RseA-like  36.26 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2176  anti sigma-E protein, RseA  29.59 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1004  anti sigma-E protein, RseA  29.58 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59721  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1008  anti sigma-E protein, RseA  28.64 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2785  sigma factor negative regulatory protein RseA family  29.53 
 
 		 200 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1128  anti sigma-E protein, RseA  28.17 
 
 		 205 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0648  anti sigma-E protein, RseA  28.17 
 
 		 205 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>