29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3067 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3067  anti sigma-E protein, RseA  100 
 
 		 213 aa  423  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3642  anti sigma-E protein RseA  63.37 
 
 		 199 aa  213  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1190  anti sigma-E protein, RseA  42.4 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1737  anti sigma-E protein RseA  40.93 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.27797  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1396  anti sigma-E protein, RseA  38.79 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3245  anti sigma-E protein, RseA  46.63 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0106156 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2626  anti sigma-E protein, RseA  38.25 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3273  anti sigma-E protein, RseA  38.25 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221066  normal  0.389812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5266  anti sigma-E protein, RseA  35.37 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0643  putative transmembrane sigma-E factor negative regulatory transcription regulator protein  38.91 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483517  normal  0.192651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0604  anti sigma-E protein, RseA  32.39 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000998375 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2094  hypothetical protein  42.11 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1084  anti sigma-E protein, RseA  35.37 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1079  anti sigma-E protein, RseA  31.25 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0986  anti sigma-E protein, RseA  28.16 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.99218  normal  0.105676 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2176  anti sigma-E protein, RseA  30.29 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0835  anti sigma-E protein, RseA  28.71 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1955  anti sigma-E protein, RseA  33.33 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.17101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0921  anti sigma-E protein, RseA  27.59 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2320  anti sigma-E protein, RseA  28.28 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2044  sigma-E factor negative regulatory protein RseA  41.82 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1795  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  27.1 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2809  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  27.1 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2472  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  27.1 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2424  anti sigma-E protein RseA  26.83 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0241315  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0537  sigma factor algU regulatory protein MucA, putative  27.1 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587813  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1004  anti sigma-E protein, RseA  28.37 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59721  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03541  negative regulator of sigma E activity  36.62 
 
 		 212 aa  42  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1747  anti sigma-E protein RseA  35.63 
 
 		 188 aa  41.6  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>