61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1747 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1747  anti sigma-E protein RseA  100 
 
 		 188 aa  379  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0643  putative transmembrane sigma-E factor negative regulatory transcription regulator protein  28.08 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483517  normal  0.192651 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2094  hypothetical protein  30.99 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1001  hypothetical protein  35 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000551436  normal  0.0534143 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0857  hypothetical protein  35 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000656151  normal  0.0292756 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2176  anti sigma-E protein, RseA  30.05 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1008  anti sigma-E protein, RseA  31.58 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1128  anti sigma-E protein, RseA  29.65 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0648  anti sigma-E protein, RseA  29.65 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2320  anti sigma-E protein, RseA  25.93 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4240  anti sigma-E protein, RseA  30 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2465  anti sigma-E protein RseA-like  38.67 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1086  anti sigma-E protein, RseA  29.44 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1004  anti sigma-E protein, RseA  31.05 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59721  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1795  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  28.35 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2809  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  28.35 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2472  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  28.35 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0537  sigma factor algU regulatory protein MucA, putative  28.35 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587813  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1737  anti sigma-E protein RseA  25.73 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.27797  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1079  anti sigma-E protein, RseA  30.54 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0604  anti sigma-E protein, RseA  29.33 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000998375 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03004  sigma E factor negative regulatory protein  43.06 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000104039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1183  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  29.67 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.013522  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3605  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  29.67 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2790  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  26.86 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00342935  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1130  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  29.67 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0835394  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03541  negative regulator of sigma E activity  38.96 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1955  anti sigma-E protein, RseA  34.25 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.17101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2900  putative sigma E factor negative regulatory protein  29.02 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2785  sigma factor negative regulatory protein RseA family  29.02 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002492  sigma factor RpoE negative regulatory protein RseA  32.38 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0123192  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1724  sigma factor algU regulatory protein MucA, putative  29.02 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2847  sigma factor negative regulatory protein RseA family  29.02 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3154  sigma-E factor negative regulatory protein  35.19 
 
 		 200 aa  45.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000214803  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3059  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  33.72 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185933  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2905  anti sigma-E protein, RseA  29.19 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131294  normal  0.588915 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1190  anti sigma-E protein, RseA  27.1 
 
 		 207 aa  45.1  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2858  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  40 
 
 		 216 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0465052  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2937  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  40 
 
 		 216 aa  44.7  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.339714  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02430  hypothetical protein  40 
 
 		 216 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02466  anti-sigma factor  40 
 
 		 216 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1096  anti sigma-E protein, RseA  40 
 
 		 216 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.076128  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2727  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  40 
 
 		 216 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.246121  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2725  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  40 
 
 		 216 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.07615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1105  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  40 
 
 		 216 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1063  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  31.98 
 
 		 221 aa  44.7  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000155817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3809  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  40 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0371131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2626  anti sigma-E protein, RseA  39.44 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0921  anti sigma-E protein, RseA  37.5 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0986  anti sigma-E protein, RseA  26.37 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.99218  normal  0.105676 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2853  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  40 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.372859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2849  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  40 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.868884  normal  0.164136 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2965  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  40 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2749  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  40 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.441788  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2831  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  40 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1084  anti sigma-E protein, RseA  32.88 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3076  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  35.96 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3067  anti sigma-E protein, RseA  35.63 
 
 		 213 aa  42  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3273  anti sigma-E protein, RseA  27.14 
 
 		 207 aa  41.6  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221066  normal  0.389812 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1199  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  35.96 
 
 		 215 aa  41.6  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000199919  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3675  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  37.35 
 
 		 217 aa  41.2  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.454383  normal  0.424445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>