66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2320 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2320  anti sigma-E protein, RseA  100 
 
 		 179 aa  355  1.9999999999999998e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1001  hypothetical protein  36.49 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000551436  normal  0.0534143 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0857  hypothetical protein  36.49 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000656151  normal  0.0292756 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1096  anti sigma-E protein, RseA  32.73 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.076128  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02430  hypothetical protein  32.73 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3809  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  32.73 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0371131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2937  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  32.73 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.339714  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2725  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  32.73 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.07615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1105  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  32.73 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2858  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  32.73 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0465052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2727  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  32.73 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.246121  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02466  anti-sigma factor  32.73 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1130  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  33.04 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0835394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3605  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  33.04 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1183  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  33.04 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.013522  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2965  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  34.23 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2749  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  34.23 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.441788  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2831  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  34.23 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2853  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  34.23 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.372859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2849  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  34.23 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.868884  normal  0.164136 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2465  anti sigma-E protein RseA-like  34.72 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2094  hypothetical protein  32.68 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0986  anti sigma-E protein, RseA  35.35 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.99218  normal  0.105676 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2790  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  37.84 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00342935  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0643  putative transmembrane sigma-E factor negative regulatory transcription regulator protein  33.33 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483517  normal  0.192651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2258  anti sigma-E protein RseA, N-terminal  30.46 
 
 		 212 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14596  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2424  anti sigma-E protein RseA  36.46 
 
 		 218 aa  52.4  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0241315  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3059  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  30.91 
 
 		 216 aa  52  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185933  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3675  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  31.85 
 
 		 217 aa  52  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.454383  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1955  anti sigma-E protein, RseA  38.16 
 
 		 189 aa  52  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.17101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3076  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  35.14 
 
 		 215 aa  51.2  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1199  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  36.49 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000199919  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0537  sigma factor algU regulatory protein MucA, putative  40.22 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587813  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03541  negative regulator of sigma E activity  36.23 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2472  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  40.22 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1747  anti sigma-E protein RseA  26.34 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2809  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  40.22 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002492  sigma factor RpoE negative regulatory protein RseA  36.76 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0123192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1795  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  40.22 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1238  anti sigma-E protein, RseA  28.08 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  hitchhiker  0.000016477 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1032  anti sigma-E protein, RseA  32.14 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000142789  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0921  anti sigma-E protein, RseA  32.32 
 
 		 210 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0604  anti sigma-E protein, RseA  35.9 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000998375 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2044  sigma-E factor negative regulatory protein RseA  35.29 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3154  sigma-E factor negative regulatory protein  31.71 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000214803  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2905  anti sigma-E protein, RseA  35.9 
 
 		 209 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131294  normal  0.588915 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2934  anti sigma-E protein RseA domain-containing protein  26.8 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0136757  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2250  secretion protein HlyD  36.84 
 
 		 224 aa  45.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471731  normal  0.0806236 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0875  sigma-E factor negative regulatory protein  34.67 
 
 		 198 aa  45.1  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.304231  normal  0.0528979 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1084  anti sigma-E protein, RseA  34.21 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1079  anti sigma-E protein, RseA  35.9 
 
 		 214 aa  45.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3067  anti sigma-E protein, RseA  28.28 
 
 		 213 aa  44.7  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1049  anti sigma-E protein, RseA  27.89 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00135611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2176  anti sigma-E protein, RseA  38.67 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1343  sigma-E factor negative regulatory protein  28.38 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1143  anti sigma-E protein, RseA  28.77 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000468966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2530  sigma-E factor negative regulatory protein  26.4 
 
 		 205 aa  41.6  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1737  anti sigma-E protein RseA  31.18 
 
 		 214 aa  42  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.27797  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2900  putative sigma E factor negative regulatory protein  38.89 
 
 		 200 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2847  sigma factor negative regulatory protein RseA family  38.89 
 
 		 200 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2785  sigma factor negative regulatory protein RseA family  38.89 
 
 		 200 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1196  anti sigma-E protein, RseA  25.5 
 
 		 208 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000269656  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1063  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  40.43 
 
 		 221 aa  41.2  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000155817  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3117  anti sigma-E protein, RseA  25.5 
 
 		 208 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10533  normal  0.0310587 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1273  anti sigma-E protein, RseA  25.5 
 
 		 208 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1240  anti sigma-E protein, RseA  25.5 
 
 		 208 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000610666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>