26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1737 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1737  anti sigma-E protein RseA  100 
 
 		 214 aa  431  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.27797  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1190  anti sigma-E protein, RseA  42.72 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3067  anti sigma-E protein, RseA  40.93 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1396  anti sigma-E protein, RseA  40.35 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3642  anti sigma-E protein RseA  45.15 
 
 		 199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3273  anti sigma-E protein, RseA  42.23 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221066  normal  0.389812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2626  anti sigma-E protein, RseA  42.93 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0643  putative transmembrane sigma-E factor negative regulatory transcription regulator protein  39.52 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483517  normal  0.192651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5266  anti sigma-E protein, RseA  34.63 
 
 		 238 aa  98.2  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3245  anti sigma-E protein, RseA  42.16 
 
 		 202 aa  92.8  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0106156 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0604  anti sigma-E protein, RseA  31.58 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000998375 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0835  anti sigma-E protein, RseA  27.05 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2472  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  26.64 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2809  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  26.64 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1795  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  26.64 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0537  sigma factor algU regulatory protein MucA, putative  26.64 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587813  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2905  anti sigma-E protein, RseA  28.11 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131294  normal  0.588915 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1955  anti sigma-E protein, RseA  36.36 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.17101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1079  anti sigma-E protein, RseA  26.32 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2176  anti sigma-E protein, RseA  25.73 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2044  sigma-E factor negative regulatory protein RseA  35.71 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03541  negative regulator of sigma E activity  39.29 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002492  sigma factor RpoE negative regulatory protein RseA  42 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0123192  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1747  anti sigma-E protein RseA  24.63 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2320  anti sigma-E protein, RseA  31.18 
 
 		 179 aa  42  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2790  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  33.33 
 
 		 217 aa  42  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00342935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>