45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3245 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3245  anti sigma-E protein, RseA  100 
 
 		 202 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0106156 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1190  anti sigma-E protein, RseA  53.11 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3273  anti sigma-E protein, RseA  51.66 
 
 		 207 aa  160  9e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221066  normal  0.389812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2626  anti sigma-E protein, RseA  51.16 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5266  anti sigma-E protein, RseA  42.98 
 
 		 238 aa  144  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3067  anti sigma-E protein, RseA  45.67 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1737  anti sigma-E protein RseA  43.06 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.27797  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1396  anti sigma-E protein, RseA  40.62 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3642  anti sigma-E protein RseA  41.98 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0643  putative transmembrane sigma-E factor negative regulatory transcription regulator protein  39.81 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483517  normal  0.192651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0604  anti sigma-E protein, RseA  34.11 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000998375 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0537  sigma factor algU regulatory protein MucA, putative  36.76 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1795  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  36.76 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2809  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  36.76 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2472  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  36.76 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2176  anti sigma-E protein, RseA  34.15 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2847  sigma factor negative regulatory protein RseA family  34.5 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1008  anti sigma-E protein, RseA  35.27 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2900  putative sigma E factor negative regulatory protein  34.33 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2785  sigma factor negative regulatory protein RseA family  34.5 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2424  anti sigma-E protein RseA  35.14 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0241315  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1004  anti sigma-E protein, RseA  33.96 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59721  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1086  anti sigma-E protein, RseA  33.82 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0835  anti sigma-E protein, RseA  33.82 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1128  anti sigma-E protein, RseA  33.82 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0648  anti sigma-E protein, RseA  33.82 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4240  anti sigma-E protein, RseA  33.82 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1724  sigma factor algU regulatory protein MucA, putative  35.35 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2905  anti sigma-E protein, RseA  33.99 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131294  normal  0.588915 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1079  anti sigma-E protein, RseA  34.31 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0986  anti sigma-E protein, RseA  34.9 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.99218  normal  0.105676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0921  anti sigma-E protein, RseA  35.68 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2094  hypothetical protein  32.82 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2258  anti sigma-E protein RseA, N-terminal  32.98 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14596  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1955  anti sigma-E protein, RseA  43.42 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.17101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2465  anti sigma-E protein RseA-like  48.98 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1056  putative transmembrane sigma-E factor negative regulatory transcription regulator protein  36.32 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.640083 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2044  sigma-E factor negative regulatory protein RseA  50 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1049  anti sigma-E protein, RseA  32.06 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00135611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2771  sigma-E factor negative regulatory protein  29.67 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00404119  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1084  anti sigma-E protein, RseA  38.55 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1747  anti sigma-E protein RseA  37.68 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2320  anti sigma-E protein, RseA  30.26 
 
 		 179 aa  41.6  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03541  negative regulator of sigma E activity  42.31 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002492  sigma factor RpoE negative regulatory protein RseA  42.31 
 
 		 208 aa  41.2  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0123192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>