62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1079 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1079  anti sigma-E protein, RseA  100 
 
 		 214 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2905  anti sigma-E protein, RseA  92.38 
 
 		 209 aa  331  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131294  normal  0.588915 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0835  anti sigma-E protein, RseA  72.6 
 
 		 217 aa  248  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2176  anti sigma-E protein, RseA  66.2 
 
 		 209 aa  230  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1795  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  64.45 
 
 		 200 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2472  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  64.45 
 
 		 200 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2809  putative sigma factor algU regulatory protein MucA  64.45 
 
 		 200 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0537  sigma factor algU regulatory protein MucA, putative  64.45 
 
 		 200 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587813  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4240  anti sigma-E protein, RseA  66.05 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1004  anti sigma-E protein, RseA  66.67 
 
 		 209 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59721  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1086  anti sigma-E protein, RseA  66.04 
 
 		 205 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1008  anti sigma-E protein, RseA  66.51 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0648  anti sigma-E protein, RseA  65.57 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1128  anti sigma-E protein, RseA  65.57 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2900  putative sigma E factor negative regulatory protein  64.93 
 
 		 200 aa  191  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2785  sigma factor negative regulatory protein RseA family  64.93 
 
 		 200 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1724  sigma factor algU regulatory protein MucA, putative  67.3 
 
 		 200 aa  190  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2847  sigma factor negative regulatory protein RseA family  64.45 
 
 		 200 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2424  anti sigma-E protein RseA  44.2 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0241315  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0986  anti sigma-E protein, RseA  36.15 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.99218  normal  0.105676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0921  anti sigma-E protein, RseA  36.62 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0643  putative transmembrane sigma-E factor negative regulatory transcription regulator protein  40 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483517  normal  0.192651 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1056  putative transmembrane sigma-E factor negative regulatory transcription regulator protein  39.29 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.640083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2258  anti sigma-E protein RseA, N-terminal  38.98 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14596  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1396  anti sigma-E protein, RseA  33.17 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0604  anti sigma-E protein, RseA  47.5 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000998375 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1190  anti sigma-E protein, RseA  31.28 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1737  anti sigma-E protein RseA  28.51 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.27797  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3067  anti sigma-E protein, RseA  31.92 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2094  hypothetical protein  33.52 
 
 		 185 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2320  anti sigma-E protein, RseA  28.29 
 
 		 179 aa  50.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1130  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  37.65 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0835394  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1747  anti sigma-E protein RseA  30.85 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5266  anti sigma-E protein, RseA  27.4 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3605  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  37.65 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1183  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  37.65 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.013522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3273  anti sigma-E protein, RseA  50 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221066  normal  0.389812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2626  anti sigma-E protein, RseA  50 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1238  anti sigma-E protein, RseA  32.48 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  hitchhiker  0.000016477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3642  anti sigma-E protein RseA  31.69 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1032  anti sigma-E protein, RseA  38.38 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000142789  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3076  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  36.59 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1001  hypothetical protein  32.14 
 
 		 152 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000551436  normal  0.0534143 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0857  hypothetical protein  32.14 
 
 		 152 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000656151  normal  0.0292756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3245  anti sigma-E protein, RseA  30 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0106156 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3117  anti sigma-E protein, RseA  33.33 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10533  normal  0.0310587 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1343  sigma-E factor negative regulatory protein  34.62 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1273  anti sigma-E protein, RseA  33.33 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1240  anti sigma-E protein, RseA  33.33 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000610666  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1196  anti sigma-E protein, RseA  33.33 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000269656  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03541  negative regulator of sigma E activity  44.9 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1199  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  36.9 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000199919  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1955  anti sigma-E protein, RseA  37.33 
 
 		 189 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.17101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002492  sigma factor RpoE negative regulatory protein RseA  44.9 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0123192  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0875  sigma-E factor negative regulatory protein  38.16 
 
 		 198 aa  42.4  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.304231  normal  0.0528979 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1143  anti sigma-E protein, RseA  34.31 
 
 		 206 aa  42  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000468966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0066  anti sigma-E protein, RseA  33.33 
 
 		 177 aa  42  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00955502  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3031  anti sigma-E protein, RseA  34.62 
 
 		 207 aa  42  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.134253  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2935  anti sigma-E protein, RseA  34.62 
 
 		 207 aa  42  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0095897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2853  anti sigma-E protein, RseA  34.62 
 
 		 207 aa  42  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0484485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2044  sigma-E factor negative regulatory protein RseA  42.86 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03004  sigma E factor negative regulatory protein  31.25 
 
 		 193 aa  41.6  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000104039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>