68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3059 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3059  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  100 
 
 
216 aa  443  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185933  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3809  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  85.65 
 
 
212 aa  357  7e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0371131  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1096  anti sigma-E protein, RseA  87.96 
 
 
216 aa  347  8e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.076128  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02430  hypothetical protein  87.96 
 
 
216 aa  347  8e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2965  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  88.89 
 
 
216 aa  347  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2749  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  88.89 
 
 
216 aa  347  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.441788  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2831  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  88.89 
 
 
216 aa  347  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2853  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  88.89 
 
 
216 aa  347  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.372859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2849  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  88.89 
 
 
216 aa  347  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.868884  normal  0.164136 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2937  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  87.96 
 
 
216 aa  347  8e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.339714  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2725  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  87.96 
 
 
216 aa  347  8e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.07615  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1105  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  87.96 
 
 
216 aa  347  8e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353029  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2858  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  87.96 
 
 
216 aa  347  8e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0465052  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02466  anti-sigma factor  87.96 
 
 
216 aa  347  8e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2727  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  87.5 
 
 
216 aa  343  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.246121  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1183  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  64.68 
 
 
218 aa  286  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.013522  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3605  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  64.68 
 
 
218 aa  286  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0131653  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1130  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  64.68 
 
 
218 aa  286  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0835394  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3675  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  69.12 
 
 
217 aa  270  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.454383  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3076  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  60.93 
 
 
215 aa  255  5e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1199  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  60 
 
 
215 aa  249  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000199919  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2790  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  58.26 
 
 
217 aa  242  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00342935  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1063  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  56.11 
 
 
221 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000155817  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2044  sigma-E factor negative regulatory protein RseA  47.21 
 
 
212 aa  158  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03541  negative regulator of sigma E activity  42.42 
 
 
212 aa  138  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002492  sigma factor RpoE negative regulatory protein RseA  41.38 
 
 
208 aa  135  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0123192  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1606  sigma-E factor negative regulatory protein  36.13 
 
 
233 aa  131  6.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.291347  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2530  sigma-E factor negative regulatory protein  42.56 
 
 
205 aa  131  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1238  anti sigma-E protein, RseA  37.11 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  hitchhiker  0.000016477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1343  sigma-E factor negative regulatory protein  37.44 
 
 
207 aa  112  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2935  anti sigma-E protein, RseA  37.76 
 
 
207 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0095897  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2853  anti sigma-E protein, RseA  37.76 
 
 
207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0484485  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2934  anti sigma-E protein RseA domain-containing protein  38.42 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0136757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1196  anti sigma-E protein, RseA  35.71 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000269656  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1240  anti sigma-E protein, RseA  36.16 
 
 
208 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000610666  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3117  anti sigma-E protein, RseA  36.16 
 
 
208 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10533  normal  0.0310587 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1273  anti sigma-E protein, RseA  36.16 
 
 
208 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3031  anti sigma-E protein, RseA  35.48 
 
 
207 aa  109  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.134253  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1049  anti sigma-E protein, RseA  38.07 
 
 
200 aa  108  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00135611  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1154  anti sigma-E protein, RseA  36.6 
 
 
206 aa  106  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000647553  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3154  sigma-E factor negative regulatory protein  39.41 
 
 
200 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000214803  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1143  anti sigma-E protein, RseA  40.11 
 
 
206 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000468966  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0875  sigma-E factor negative regulatory protein  41.71 
 
 
198 aa  102  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.304231  normal  0.0528979 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1032  anti sigma-E protein, RseA  39.36 
 
 
201 aa  102  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000142789  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03004  sigma E factor negative regulatory protein  34.62 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000104039  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0066  anti sigma-E protein, RseA  34.25 
 
 
177 aa  85.5  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00955502  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2771  sigma-E factor negative regulatory protein  37.44 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00404119  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1627  negative regulator of sigma E activity-like protein  38.71 
 
 
263 aa  55.1  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2465  anti sigma-E protein RseA-like  38.81 
 
 
195 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1955  anti sigma-E protein, RseA  40 
 
 
189 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.17101  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1001  hypothetical protein  44.93 
 
 
152 aa  53.5  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000551436  normal  0.0534143 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0857  hypothetical protein  44.93 
 
 
152 aa  53.5  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000656151  normal  0.0292756 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2320  anti sigma-E protein, RseA  30.91 
 
 
179 aa  52.4  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4240  anti sigma-E protein, RseA  39.73 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916618  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1008  anti sigma-E protein, RseA  40.85 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225947  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1004  anti sigma-E protein, RseA  40.85 
 
 
209 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59721  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1340  anti sigma-E protein, RseA  30.77 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0581505  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0648  anti sigma-E protein, RseA  39.73 
 
 
205 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1128  anti sigma-E protein, RseA  39.73 
 
 
205 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1086  anti sigma-E protein, RseA  39.73 
 
 
205 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2250  secretion protein HlyD  44.12 
 
 
224 aa  49.3  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471731  normal  0.0806236 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1084  anti sigma-E protein, RseA  37.33 
 
 
196 aa  48.5  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2176  anti sigma-E protein, RseA  40.85 
 
 
209 aa  48.5  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01712  regulatory protein  36.59 
 
 
296 aa  46.6  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.586508  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4128  sigma-E factor negative regulatory protein RseA  23.93 
 
 
233 aa  45.4  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.564626  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1747  anti sigma-E protein RseA  34.52 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3273  anti sigma-E protein, RseA  41.3 
 
 
207 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221066  normal  0.389812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2626  anti sigma-E protein, RseA  41.3 
 
 
207 aa  41.6  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>