More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4781 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4781  response regulator receiver protein  100 
 
 		 151 aa  310  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73464  normal  0.808213 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0713  response regulator receiver domain-containing protein  47.69 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.454574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4393  response regulator receiver protein  47.69 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3992  response regulator receiver protein  34 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 224 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0241  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.38 
 
 		 582 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0095  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5291  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2998  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 		 807 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.745142 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1316  response regulator receiver domain-containing protein  35.82 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.320962  normal  0.0622647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  42.7 
 
 		 233 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3142  response regulator  37.4 
 
 		 149 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1362  CheY-like domain-containing protein  37.4 
 
 		 149 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517477  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3013  response regulator receiver  37.4 
 
 		 149 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.174134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  30.25 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  48.48 
 
 		 237 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5171  histidine kinase  46.97 
 
 		 584 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.944283 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05570  hypothetical protein  36.26 
 
 		 242 aa  61.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.71 
 
 		 234 aa  60.5  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0320  response regulator receiver domain-containing protein  37.14 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.26 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  32.2 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1287 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  32.48 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0290  response regulator receiver domain-containing protein  35 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870097  hitchhiker  0.0000582863 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  31.09 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  34.33 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  34.33 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  34.33 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  31.09 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2075  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 		 572 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.67 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  31.09 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  31.09 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1824  two component transcriptional regulator  31.09 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529032  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.63 
 
 		 1131 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  40.48 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.43 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  40.48 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  28.57 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  40.48 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  38.27 
 
 		 414 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.76 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  40.48 
 
 		 231 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1133  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.35 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  40.48 
 
 		 231 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 907 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.93 
 
 		 237 aa  57.4  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  31.36 
 
 		 254 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  38.71 
 
 		 242 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.64 
 
 		 229 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 796 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 		 866 aa  57  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  32.39 
 
 		 265 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.31 
 
 		 234 aa  57  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  31.36 
 
 		 254 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  32.39 
 
 		 265 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1287  two component transcriptional regulator  32.94 
 
 		 232 aa  57  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2790  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 463 aa  57  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 		 803 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  40.48 
 
 		 230 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 		 991 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.59 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.58 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2980  response regulator receiver protein  41.79 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  26.98 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4670  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.97 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001593  putative two-component response regulator  38.1 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000660606  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  40.24 
 
 		 1526 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  37.74 
 
 		 792 aa  57  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 776 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 		 798 aa  57  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 1927 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2142  two component transcriptional regulator  30.95 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.58 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.65 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4637  DNA-binding response regulator  36.17 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  30.51 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  40 
 
 		 1053 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  28.39 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  37.04 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 776 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 		 568 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  39.02 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0841  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.91 
 
 		 715 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0246  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0272164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  29.84 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  26.77 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  29.84 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 		 850 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4631  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 		 1672 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  40.51 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  29.84 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0154  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.443854  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.48 
 
 		 1559 aa  55.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  42.35 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>